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Single Cell RNA Sequencing은 샘플내 단일 세포 레벨에서 유전자들의 발현양을 파악하는 시퀀싱 기술입니다.
시료 내에 존재하는 세포의 분포를 파악할 수 있고 희귀하거나 알려지지 않은 세포 유형을 규명할 수 있으며,
Pseudotime 분석을 통해 세포 유형 간의 상태 변화나 분화 과정 등의 추정이 가능합니다.
또한, Immune Profiling은 각 세포 수준에서 세포의 발현 데이터와 B Cell Recector, T Cell Receptor의 V(D)J 재조합 데이터와
항체 클론형 (Clonotype) 데이터를 융합하여 시료의 Immune repertoire를 확인할 수 있습니다.
테라젠바이오는 단일 세포의 품질을 측정하여 저품질의 세포들을 제거하고 정규화하여 세포의 발현량을 측정할 수 있으며,
측정된 발현을 기준으로 세포 유형을 예측한 후 각 세포 유형 별 차별 발현 유전자 분석(DEG analysis)을 통해 유의미한 유전자 정보를 제공합니다.
또한, 세포의 유전자 발현 유사성과 차별성을 기반으로 세포의 분화 과정 및 시간 변화에 따른 유전자 발현 변화 정보를 제공합니다.
Sample Requirement | Cells >20K (minimum 1K cells), 1000cells/µl |
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Library Kit | 10x Genomics |
Sequencing Platform | Illumina NovaSeq6000 |
Recommended Sequencing Depth | - |
T-SNE
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Phlyogenetic Tree
10X Genomics Report